Generasi Terbaru Toyota Ist diluncurkan untuk pasar lokal Jepang dengan banyak perubahan dibandingkan yang lama. Ragam pilihan mesin, fitur safety serta konsep desain menjadi pembeda dengan generasi pertama. Generasi pertama diluncurkan Mei 2002, dianggap sukses meletakkan benchmark baru di segmen kendaran compact. Kualitas dan kesempurnaannya mendapat pujian banyak kalangan.

Pengembangan Ist baru ini berpijak pada filosofi desain "Vibrant Clarity". Siluet crossover yang unik terbentuk dari gabungan body lebar 1.7 meter dengan ukuran panjang yang kompak, 4 meter yang memancarkan kekuatan dan semangat SUV. Disain interior yang baru juga lebih memanjakan pengendaranya.

Teknologi katup terbaru Toyota, Dual VVT-i (Variable Valve Timing-intelligent) jadi andalan mesin baru 1.8 liter (2ZR-FE). Dual VVT-i bekerja pada kedua katup, intake dan exhaust, tidak seperti VVT-i yang hanya beroperasi di katup intake saja. Dual VVT-i mengoptimasi waktu buka-tutup katup intake dan exhaust untuk meningkatkan efisiensi bahan bakar, emisi lebih hijau dan akselerasi lebih responsif.

Toyota mengkombinasikan mesin 1.5 liter dengan gearbox Super CVT-i (Continuously Variable Transmission-intelligent) guna mendapatkan akselerasi yang lembut dan mulus, sekaligus berimbas pada efisiensi bahan bakar. Data pengujian Japanese Ministry of Land, Infrastructure and Transport, model 1.5 liter dengan sistem penggerak roda depan mampu mencapai 18.0km/liter, 10% lebih baik dari level minimal standar fuel efficieny Jepang untuk tahun 2010. Emisi CO2 hanya 129g/km sedangkan emisi NOx (Nitrogen Oksida) dan NMHC (non-metana hidrokarbon) juga direduksi. Khusus mesin 1.5 liter ditawarkan pula dengan sistem penggerak 4 roda.

Dirakit di Takaoka Plant, model ini ditargetkan terjual 2000 unit perbulan dengan harga mulai dari 1.66 juta Yen hingga 1,995 juta Yen untuk versi 1.5 liter dan 1.89 juta yen untuk yang menggunakan mesin 1.8 liter.